Elektronický recept momentálne nie je možné vystaviť napríklad na lieky, ktoré sú plne hradené pacientom, a lekári musia predpisovať papierové recepty.
Rezort zdravotníctva už intenzívne rieši problematiku s Národným centrom zdravotníckych informácií (NCZI) a zástupcami jednotlivých zdravotných poisťovní.