Kontrolóri identifikovali aj nedostatočnú implementácia systému DRG, finančné problémy Všeobecnej zdravotnej poisťovne, ale i riziko vážnych problémov v ambulantnom sektore.
Súčasný stav zákonných noriem podľa ministerstva neumožňuje efektívne riešiť problematiku evidencie tzv. „mŕtvych duší“ v centrálnom registri poistencov.
Výdavky spojené s prevádzkou štátnej zdravotnej poisťovne predstavujú 111,7 milióna eur a výdavky za správu pre súkromné zdravotné poisťovne v sume 96,6 milióna eur.