Na modernizácii železničnej trate priamo v meste vznikajú problémy, ktoré sťažujú obyvateľom život. Najnovšie hrozí, že vzniknú ešte väčšie dopravné komplikácie mestskej časti Sihoť s dvanásťtisíc obyvateľmi.
Dôvodom vyradenia projektu z OPD boli dlhotrvajúce domáce súdne spory o priebehu tendra na zhotoviteľa prác, ako aj pre prešetrovanie porušenia pravidiel Európskej únie.
